加入WTO后，我国现行行政管理观念、制度、体制、方式、手段等都需要进行改革。
转变政府职能、实现政企分开
过去，我们的政府往往与企业或经济集团的经济利益直接联系在一起，政府开办的企业有时会成为政府机关获取利益的手段，有时也会让政府背上沉重的包袱，不仅破坏了公平的竞争秩序，也损害了政府的威信和地位。在社会主义市场经济体制下，要进一步转变政府职能，实现政企分开。把政府职能，转变到经济调节、社会管理、公共服务上来，把企业的生产经营权和投资决策权真正交给企业，把社会可以自我调节和管理的职能交给社会中介组织，把群众自治范围内的事情交给群众自己依法办理。
清理内部文件，提高贸易政策的透明度
一些地方和部门习惯于通过内部文件办事情，有的甚至通过下发内部文件，乱发证、乱收费，或者变相进行地区封锁、行业垄断，这些做法必须制止，对以前下发的内部文件要进行清理。我国加入WTO后，任何地方、部门制定的涉及货物贸易、服务贸易、与贸易有关的知识产权保护和有关投资措施的地方性法规、规章和政策措施都要公开发布，提高贸易政策的透明度，以便各国政府及贸易商对它们熟悉。
加快行政审批制度改革
我国的审批制度特点是审批范围广、事项杂、环节多，受法律的制约少，审批的自由裁量权大。因此，加快行政审批制度改革已成为当务之急。首先，要对现有的各种审批进行一次系统清理。在清理的基础上，尽快取消和简化现存大多数的行政审批。
精简机构人员，走向透明政府、透明管理
在社会主义市场经济条件下，要精简机构人员，转变工作方式和作风，办事手续越简单越好，应该让守法的人办合法的事时，处处方便，感觉不到谁在管他，让违法的人办违法的事时，处处受阻，每个环节都在管他。为了提高效率并防止腐败，从政府的机构设置、人员安排、职责权限，到管理的运转规则和方式，都应该公开，以便实现透明政府，透明管理。
加强和改善政府对市场秩序管理
当前我国正处在建立和完善社会主义市场经济体制阶段，不断有融资、集资诈骗等案件发生，经营者不注重商业信誉，资金相互拖欠严重，坑蒙拐骗，虚假广告、商业欺诈和假冒伪劣商品大量存在，侵犯知识产权现象非常严重。要改变这种现象，必须加强和改善政府对市场的管理。我们应当借鉴国外市场经济发达国家在这方面的管理经验，制定、完善市场日常监督管理制度，规定经营者对日常经营行为必须做详细具体的记录，管理者视情况定期或不定期检查经营者的经营行为和经营记录，调取经营资料，一旦发现经营记录不全面、不完整，该记录的没有记录，该企业就有逃避监管的嫌疑，因而要提高对该企业日常检查的频率；
如果发现企业有违法行为，则以企业日常经营记录作为可靠证据进行行政处罚。政府要下大决心打击制售伪劣商品的犯罪活动，保护企业合法利益，规范市场秩序，营造公平竞争的市场环境，为企业提供优质服务，创造良好的外部环境。
强化政府服务职能
当前，特别需要加强政府的经济政策和经济信息咨询服务，积极探讨建立各级政府、不同行业、同业及境内外之间的信息沟通网络，加强政府的信息服务，及时搜集、分析、整理国内外市场信息，并及时将信息传到企业界，提高全社会的信息分享程度，优化企业投资环境，同时逐步建立起信用担保、筹资融资、创业辅导、技术支持、人才培训、就业指导、国际合约等服务体系，从而为社会主义市场经济提供优质服务。